Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
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