Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms