Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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TRAF1Q13077 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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TRAF1Q13077 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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TRAF1Q13077 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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