Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms