Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPS29P62273 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPS29P62273 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPS29P62273 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 IL22RA2-203ENST00000349184 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPS29P62273 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms