Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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MTSS1O43312 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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MTSS1O43312 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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MTSS1O43312 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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MTSS1O43312 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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MTSS1O43312 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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MTSS1O43312 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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MTSS1O43312 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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MTSS1O43312 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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MTSS1O43312 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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