Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARFGEF1Q9Y6D6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF1Q9Y6D6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARFGEF1Q9Y6D6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARFGEF1Q9Y6D6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARFGEF1Q9Y6D6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms