Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZDHHC9Q9Y397 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZDHHC9Q9Y397 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZDHHC9Q9Y397 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZDHHC9Q9Y397 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZDHHC9Q9Y397 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC9Q9Y397 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms