Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms