Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMCC3Q9ULS5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms