Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms