Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RARRES3Q9UL19 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RARRES3Q9UL19 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RARRES3Q9UL19 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RARRES3Q9UL19 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RARRES3Q9UL19 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RARRES3Q9UL19 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms