Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms