Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms