Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms