Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms