Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms