Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms