Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1Q96NA8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms