Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms