Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms