Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELP4Q96EB1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms