Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSUN4Q96CB9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms