Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCC1Q92922 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCC1Q92922 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCC1Q92922 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCC1Q92922 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCC1Q92922 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCC1Q92922 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCC1Q92922 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCC1Q92922 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCC1Q92922 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCC1Q92922 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCC1Q92922 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCC1Q92922 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCC1Q92922 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCC1Q92922 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCC1Q92922 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCC1Q92922 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCC1Q92922 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCC1Q92922 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms