Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY2Q8WXA3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms