Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL11Q8NHH1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms