Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMIEQ8NEW7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms