Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms