Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms