Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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