Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNL1Q8IU54 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms