Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms