Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LDLRAD1Q5T700 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LDLRAD1Q5T700 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LDLRAD1Q5T700 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LDLRAD1Q5T700 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRAD1Q5T700 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRAD1Q5T700 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRAD1Q5T700 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRAD1Q5T700 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRAD1Q5T700 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRAD1Q5T700 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRAD1Q5T700 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRAD1Q5T700 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRAD1Q5T700 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRAD1Q5T700 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms