Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC9

AKAP4, A-kinase anchor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP4Q5JQC9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP4Q5JQC9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AKAP4Q5JQC9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms