Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP55Q53EZ4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms