Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms