Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRNQ4KMQ1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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