Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-1Q3LI63 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
KRTAP20-1Q3LI63 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
KRTAP20-1Q3LI63 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
KRTAP20-1Q3LI63 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
KRTAP20-1Q3LI63 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
KRTAP20-1Q3LI63 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
KRTAP20-1Q3LI63 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
KRTAP20-1Q3LI63 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-1Q3LI63 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-1Q3LI63 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-1Q3LI63 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-1Q3LI63 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-1Q3LI63 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-1Q3LI63 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-1Q3LI63 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-1Q3LI63 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-1Q3LI63 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-1Q3LI63 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-1Q3LI63 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-1Q3LI63 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms