Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms