Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
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