Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RYR3Q15413 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RYR3Q15413 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RYR3Q15413 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RYR3Q15413 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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RYR3Q15413 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms