Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms