Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
GAPVD1Q14C86 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC32■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms