Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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GPNMBQ14956 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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GPNMBQ14956 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
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