Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms