Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
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TUBB3Q13509 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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TUBB3Q13509 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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