Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRSQ13332 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms