Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms