Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RESTQ13127 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RESTQ13127 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RESTQ13127 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RESTQ13127 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RESTQ13127 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RESTQ13127 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RESTQ13127 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RESTQ13127 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RESTQ13127 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RESTQ13127 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RESTQ13127 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RESTQ13127 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RESTQ13127 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RESTQ13127 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RESTQ13127 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RESTQ13127 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RESTQ13127 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RESTQ13127 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RESTQ13127 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RESTQ13127 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RESTQ13127 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RESTQ13127 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RESTQ13127 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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