Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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FOXC1Q12948 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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FOXC1Q12948 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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FOXC1Q12948 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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FOXC1Q12948 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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FOXC1Q12948 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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FOXC1Q12948 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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FOXC1Q12948 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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